Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ATP6AP1Q15904 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ATP6AP1Q15904 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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