Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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