Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FAM53BQ14153 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FAM53BQ14153 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms