Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMC2Q13753 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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