Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ATP1A4Q13733 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ATP1A4Q13733 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ATP1A4Q13733 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ATP1A4Q13733 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ATP1A4Q13733 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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ATP1A4Q13733 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATP1A4Q13733 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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