Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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