Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGB3BPQ13352 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGB3BPQ13352 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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