Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
STRN3Q13033 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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