Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NPRL3Q12980 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms