Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
FOXD4Q12950 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FOXD4Q12950 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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