Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CDH17Q12864 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CDH17Q12864 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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