Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TROQ12816 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TROQ12816 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TROQ12816 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TROQ12816 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TROQ12816 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TROQ12816 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TROQ12816 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TROQ12816 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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