Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC15Q0P6D6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms