Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNA1Q09470 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms