Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
SRSF4Q08170 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms