Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALD1Q05682 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms