Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPN12Q05209 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms