Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CHRNEQ04844 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms