Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2FP61218 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms