Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THOP1P52888 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
THOP1P52888 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
THOP1P52888 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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