Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2A2P52657 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GTF2A2P52657 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms