Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMARCA4P51532 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMARCA4P51532 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms