Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PEX5P50542 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PEX5P50542 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PEX5P50542 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PEX5P50542 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms