Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FNTAP49354 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms