Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TM4SF4P48230 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms