Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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