Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPD2P43304 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPD2P43304 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms