Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
USP8P40818 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP8P40818 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP8P40818 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP8P40818 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
USP8P40818 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
USP8P40818 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
USP8P40818 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
USP8P40818 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms