Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms