Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPARGP37231 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms