Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E1P29083 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms