Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GJB2P29033 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms