Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms