Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HRCP23327 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HRCP23327 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HRCP23327 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms