Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA6P23229 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms