Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGA4P13612 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms