Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
VPREB1P12018 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms