Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPCP11686 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms