Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms