Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC175P0C221 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms