Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HLA-DQB1P01920 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HLA-DQB1P01920 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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