Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC24AO95486 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC24AO95486 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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