Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAPLNO95428 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAPLNO95428 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PAPLNO95428 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PAPLNO95428 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms