Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
GOLGA8SH3BPF8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms