Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRRT4C9JH25 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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