Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HMGB1P1B2RPK0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms