Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FRMD3A2A2Y4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms