Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNRF3Q9ULT6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.8 ms