Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DUX4Q9UBX2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms