Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTNNAL1Q9UBT7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms